Спокойствие мегаполиса Зверополис нарушено появлением таинственной рептилии — существа древнего и невероятно опасного. Его способность менять окраску, mimicry и исчезать без следа ставит в тупик всю полицию. Город погружается в хаос: то тут, то там происходят загадочные ограбления и диверсии, а виновный остаётся невидимкой. Комиссар полиции поручает самое сложное дело своей лучшей команде — отважному кролику Джуди Хоппс и харизматичному лису Нику Уайлду. Но на этот раз их проверенная тактика «брать напором и обаянием» не срабатывает. Чтобы проникнуть в разные, глубоко законспирированные слои преступного мира Зверополиса, им приходится работать порознь. Джуди, притворяясь наивной провинциалкой, внедряется в банду уличных мошенников в дождливом районе Тундры, где правят хулиганы-росомахи. Тем временем Ник, используя весь свой врождённый талант афериста, втирается в доверие к роскошным и подозрительным бизнесменам в фешенебельном Саванна-Сити. Их миссия — опасна и сложна. Они не могут выходить на связь друг с другом, рискуя раскрыть себя. Каждый на своем конце города собирает части пазла, ведущего к загадочной рептилии. Но чем ближе они подбираются к разгадке, тем яснее понимают, что имеют дело не просто с преступником, а с кем-то, кто бросает вызов самим устоям Зверополиса, намеренно стравливая его жителей. Чтобы остановить его, Джуди и Нику придётся не просто раскрыть дело — им нужно вновь научиться доверять друг другу, даже находясь на расстоянии, и синхронизировать свои действия для финальной операции, где ставкой будет будущее всего города.